這波聯名的第二彈是「EVA 漢堡」（エヴァンゲリオンバーガー），2025 年 1 月 6 日起期間限定販售，三款漢堡都改用以劇中「A.T. 力場」為發想的原創麵包：新品厚切薯塊厚牛蒜香美乃滋堡、新品墨西哥起司雞肉堡，以及再度登場的雙層照燒起司堡。依日本麥當勞新聞稿，發售前會在官方 X 帳號陸續公開 5 支 14 到 20 秒左右的原創短片，用動畫場景與經典台詞替新品暖身。

這支短片一次介紹三款漢堡。穿白袍的研究員在貼滿紙張的狹窄通道裡翻到 EVA 漢堡的配方，驚嘆其中的巧思難怪這麼好吃；畫面也切到真嗣手拿紙條、美里湊在一旁看的場景。最後有人一句「其實直接去麥當勞買不就好了嗎？」，讓這場研究收在一句吐槽上。

片名「決戦、3 種のバーガー」改自原作第 6 集的標題「決戦、第 3 新東京市」，把「第 3 新東京市」換成三款漢堡，片尾同樣以初號機與二號機的畫面標示 1 月 6 日星期一發售。

參考來源：日本麥當勞新聞稿〈“エヴァンゲリオン×マクドナルド” 奇跡のコラボ第二弾〉、日本麥當勞 EVA 漢堡活動頁（Internet Archive 2025 年 1 月 8 日存檔）、維基百科日文版〈新世紀エヴァンゲリオン〉各集標題。原始標題：エヴァンゲリオンバーガー「決戦、3種のバーガー」篇